Sedert die begin van die pandemie het diagnostiese toetse 'n belangrike rol gespeel in die beheer van die verspreiding van SARS-CoV-2, die virus wat veroorsaakCOVID 19.Vinnige antigeentoetsewat tuis of in 'n kliniese omgewing uitgevoer word, lewer resultate binne 15 minute of minder.Hoe vroeër 'n persoon gediagnoseer word, hoe gouer kan hulle mediese hulp soek en hulself van ander isoleer.Maar wanneer nuwe variante van die virus verskyn, word daardie variante moontlik nie deur hierdie toetse opgespoor nie.
Die meeste vinnige antigeentoetse is ontwerp om die SARS-CoV-2-nukleokapsiedproteïen of N-proteïen op te spoor.Hierdie proteïen word in oorvloed aangetref in virale deeltjies en besmette mense.Vinnige toetsstels bevat gewoonlik twee verskillende diagnostiese teenliggaampies wat aan verskillende dele van die N-proteïen bind.Wanneer 'n teenliggaam aan die N-proteïen in 'n monster bind, verskyn 'n gekleurde lyn of ander sein op die toetsstel, wat 'n infeksie aandui.
Proteïen N bestaan ​​uit 419 aminosuur strukturele eenhede.Enige van hulle kan deur 'n mutasie deur 'n ander aminosuur vervang word.Navorsingsgroep onder leiding van Ph.D.Philip Frank en Eric Ortlund van die Emory Universiteit het ondersoek ingestel na hoe hierdie enkele aminosuurverandering die prestasie van 'n vinnige antigeentoets beïnvloed.Hulle het 'n tegniek genaamd diep mutasieskandering gebruik om gelyktydig te bepaal hoe elke mutasie in die N-proteïen van die virus binding aan 'n diagnostiese teenliggaam beïnvloed.Hul resultate is op 15 September 2022 in Cell gepubliseer.
Die navorsers het 'n omvattende biblioteek van byna 8 000 N-proteïenmutasies geskep.Hierdie variante is verantwoordelik vir meer as 99,5% van alle moontlike mutasies.Hulle het toe geëvalueer hoe elke variant in wisselwerking met 17 verskillende diagnostiese teenliggaampies wat in 11 kommersieel beskikbare vinnige antigeentoetse gebruik is, insluitend algemenetuisstelle.
Die span het beoordeel watter N-proteïenmutasies die herkenning van teenliggaampies beïnvloed.Op grond van hierdie inligting het hulle 'n "ontsnapmutasieprofiel" vir elke diagnostiese teenliggaam geskep.Hierdie profiel identifiseer spesifieke mutasies in die N-proteïen wat die vermoë van die teenliggaam om aan sy teiken te bind, kan beïnvloed.Die ontleding het getoon dat die teenliggaampies wat in vandag se vinnige toetse gebruik word, alle vorige en huidige variante van SARS-CoV-2 erken en bind.
Alhoewel verskeie diagnostiese teenliggaampies dieselfde streek van die N-proteïen herken, het die navorsers gevind dat elke teenliggaam 'n unieke handtekening van ontsnappingsmutasies het.Aangesien die SARS-CoV-2-virus aanhou muteer en nuwe variante genereer, kan hierdie data gebruik word om toetsstel-teenliggaampies te vlag wat dalk heroorweeg moet word.
"Akkurate en doeltreffende identifikasie van besmette individue bly 'n kritieke strategie vir COVID-19-versagting, en ons studie verskaf inligting oor toekomstige SARS-CoV-2-mutasies wat met opsporing kan inmeng," het Ortlund gesê."Die resultate wat hier uiteengesit word, stel ons in staat om vinnig by hierdie virus aan te pas namate nuwe variante voortgaan om na vore te kom, wat onmiddellike kliniese en openbare gesondheidsimplikasies inhou."
Agtergrond: Mutation Deep Scan bespeur ontsnappingsmutasies in die SARS-CoV-2-nukleokapsied deur tans beskikbare vinnige antigeentoetse te gebruik.Frank F., Kin MM, Rao A., Bassit L., Liu H, Bowers HB, Patel AB, Kato ML, Sullivan JA, Greenleaf M., Piantadosi A., Lam VA, Hudson VH, Ortlund EA sel.2022 15 September;185(19):3603-3616.e13.Ministerie van Binnelandse Sake: 10.1016/j.cell.2022.08.010.29 Augustus 2022 PMID: 36084631.
Befondsing: Nasionale Instituut vir Biomediese Beelding en Bio-ingenieurswese NIH (NIBIB), Nasionale Instituut vir Diabetes, Spysverterings- en Niersiektes (NIDDK) en Nasionale Instituut vir Allergie en Aansteeklike Siektes (NIAID), American Heart Association.
NIH Research Matters is 'n weeklikse opdatering van sleutel NIH-navorsingsbevindinge wat deur NIH-kundiges hersien word.Dit word gepubliseer deur die Kantoor vir Kommunikasie en Openbare Sake van die Direkteur van die National Institutes of Health.